第三十七章 孟德尔随机化

第三十七章 孟德尔随机化 (第1/2页)

陈飞决定迅速把系统给他的奖励付诸实践。
　　
　　他的目光扫过桌上的实验笔记本，一切看起来都准备就绪。
　　
　　这篇文章主要是分析RNA-seq数据，以评估不同肝细胞癌患者与健康对照组的RNA表达情况。
　　
　　我们得从头开始解释一下，RNA是啥。
　　
　　RNA，全称为核糖核酸（RibonucleicAcid），是遗传信息在细胞中的重要载体。
　　
　　DNA，或者说脱氧核糖核酸，是生命中最核心的信息载体，负责存储所有的遗传信息。它就像一个大老板，掌控着一切。
　　
　　然而，这个大老板的工作方式非常大老板——它拥有所有的决策权，也从不亲自下场干活。
　　
　　DNA不会直接合成生命所需的蛋白质，而是需要“翻译员”和“信使”来帮忙。
　　
　　这个信使，就是RNA——核糖核酸。DNA负责储存所有的遗传信息，但它不能直接参与蛋白质的合成。
　　
　　RNA从DNA上复制出特定的基因信息，然后带着这些信息离开细胞核，到达细胞质中的小弟“工厂”——核糖体，在那里按照基因的指令生产蛋白质。
　　
　　蛋白质，说白了，是一组由氨基酸构成的大分子。虽然它们的组成看起来没那么复杂，但功能可就复杂得多了。
　　
　　蛋白质是生命的“多面手”，它们几乎参与了所有的生物过程。
　　
　　因此，进行RNA表达分析，实际上可以揭示它受到哪些基因调控，又影响了哪些下游发挥功能的打工人蛋白质，可谓是承上启下，对于揭示疾病的分子机制至关重要。
　　
　　而他现在要做的，就是利用这些RNA-seq数据，找到那些在肝细胞癌中异常表达的基因。
　　
　　RNA-seq是一种利用下一代测序技术（NGS）来捕获和量化样本中所有RNA分子的技术，它能让科学家们在分子水平上解码细胞如何运作，以及癌细胞和健康细胞有何不同。
　　
　　“对，就是它。”陈飞将目光聚焦在数据分析上，屏幕上闪烁着成百上千条RNA序列的信息。
　　
　　系统以肝细胞癌作为切入点，因为这种癌症在全球范围内高发，而且致死率高，需要更有效的治疗手段。
　　
　　这种癌症是全球第六大最常见的癌症，同时也是癌症相关死亡的第三大原因。
　　
　　HCC（HepatocellularCarcinoma，肝细胞癌）与慢性肝病密切相关，尤其是乙型肝炎和丙型肝炎的感染。
　　
　　由于肝脏是人体的主要解毒器官，肝细胞癌的发展与遗传突变、环境因素和病毒感染等多种复杂机制相关。
　　
　　为了研究这些机制，陈飞决定利用系统提供的实验思路，将现代生物信息学和孟德尔的随机化思想结合起来，找出与肝细胞癌相关的关键基因。
　　
　　这对于后续开发出有效的治疗方法有很大的意义。
　　
　　设计实验的第一步：获取RNA-seq数据
　　
　　陈飞抱紧系统大腿，快速打开了公开数据平台“GEO数据库”，这里有大量的公开生物学数据，其中就包括RNA-seq数据。
　　
　　他选择了几组肝细胞癌患者的样本，并找到相对应的健康对照组的数据。
　　
　　这一步非常关键。RNA-seq数据庞大而复杂，需要通过严格的筛选和清洗，才能得出有效的差异表达基因（DEGs）。
　　
　　

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